Inhibe la germinación de las semillas o estimula la germinación latente de las semillas. Los altos niveles de ácido jasmónico promueven el almacenamiento de proteínas; los genes que codifican las proteínas de almacenamiento de las plantas responden al ácido jasmónico, y se cree que el ácido tuberónico (un derivado del ácido jasmónico) juega un papel importante. Un papel en la formación de tubérculos en las plantas puede provocar una reducción de la clorofila e inhibir la expresión de genes que codifican proteínas relacionadas con la fotosíntesis. Aunque se desconoce la causa de este fenómeno, se cree que dicha reacción reduce la capacidad de la planta para asimilar el exceso de luz y dióxido de carbono. Aún no se conoce el papel de la acumulación de jasmonato en flores y frutos, pero puede estar relacionado con la maduración del fruto (a través del etileno), la síntesis de carotenoides en el fruto y la expresión de genes que codifican proteínas de almacenamiento de semillas y plantas. resistencia a insectos y enfermedades. Muchos genes relacionados con la resistencia de las plantas son expresados por el ácido jasmónico, y el ácido jasmónico y el etileno también tienen el mismo papel en la respuesta de resistencia. Al igual que las auxinas, el ácido jasmónico también se detecta a través del sistema de ubiquitina. Cuando el ácido jasmónico y la isoleucina se combinan, hará que la ubiquitina ligasa SCFCOI1 E3 marque la proteína JAZ, y luego la proteasa degradará la proteína JAZ marcada y luego se liberarán los factores de transcripción inhibidos por la proteína JAZ, activando la transcripción genética regulada aguas abajo. .