El predecesor de la escuela fue la Facultad de Medicina Tradicional China del Noroeste, fundada en Xi'an en 1952. En 1959, se actualizó a la Facultad de Medicina Tradicional China de Shaanxi. Comenzó a reclutar y capacitar estudiantes de maestría en 1978 y fue identificada como una de las ocho escuelas de medicina tradicional china clave del país. En 1981, se convirtió en el primer grupo de unidades autorizadas para títulos de maestría en el país. En 2015, pasó a llamarse Universidad de Medicina Tradicional China de Shaanxi.
La Universidad de Medicina Tradicional China de Guizhou está ubicada en la ciudad de Guiyang, provincia de Guizhou. Es una universidad establecida conjuntamente por la Administración Estatal de Medicina Tradicional China y el Gobierno Popular de la provincia de Guizhou, una universidad piloto para la reforma del programa de educación y capacitación para talentos destacados de la medicina tradicional china y una universidad apoyada por la provincia de Guizhou.