(1) La muestra debe ser muy fina, lo más habitual es un corte de unos 50nm
(2) Debe estar fijada (glutaraldehído o ácido ósmico) embebida (epóxido resina) Después de pasos como seccionar (cuchilla de vidrio o cuchilla de diamante), teñido (acetato de uranilo o citrato de plomo), se requiere mantener bien la estructura fina de la muestra y resistir el bombardeo de haces de electrones en el vacío sin distorsión. p>
(3) Debe haber una diferencia de densidad adecuada dentro de la muestra para obtener el máximo contraste de la imagen del objeto.