Guo Baojun presidió la octava y decimotercera excavación de las Ruinas Yin respectivamente. En la decimotercera excavación, adoptó un método de excavación a gran escala, que no solo le permitió estudiar la relación de capas de las ruinas, sino también la distribución plana de cada ruina. Gracias a los métodos mejorados, los resultados de esta excavación superaron con creces los de excavaciones anteriores. Este método fue explorado gradualmente por los arqueólogos basándose en las condiciones reales de las Ruinas Yin, en lugar de ser transferido directamente de la arqueología occidental. En la primavera de 1950, Guo Baojun regresó a Anyang, provincia de Henan, durante más de medio siglo, y excavó la famosa tumba de la aldea de oficiales militares y fosas funerarias cercanas. En el sitio se han encontrado muchas reliquias y valiosas reliquias culturales que han sido robadas muchas veces, incluidos los huesos humanos de las personas asesinadas que pueden probar que era una sociedad esclavista en ese momento, y el timbre de piedra con forma de tigre más exquisito entre los las antiguas campanas de piedra que existen en China.
Guo Baojun participó dos veces en la excavación de Chengziya en la ciudad de Longshan, condado de Dongcheng, y coeditó "Chengziya" con Liang Siyong y otros, nombrándola "Cultura Longshan" por primera vez en el informe. Es más importante que la investigación textual de artefactos antiguos. Es la primera persona en nombrar la cerámica (vasijas) (tablas) comunes en la cultura Longshan.
De 1932 a 1933, Guo Baojun presidió cuatro excavaciones en Xincun, condado de Jun, Henan, y limpió 82 tumbas desde principios de la dinastía Zhou Occidental hasta principios del período de primavera y otoño. La excavación de Xincun en el condado de Junxian no solo proporcionó información valiosa para la investigación histórica, sino que también amplió el alcance de la excavación realizada por el equipo arqueológico del instituto. La era se extendió desde la dinastía Yin hasta la dinastía Zhou occidental, creando la arqueología de los Zhou. Dinastía. En su informe "Shanbiao Town·Liu Liting", planteó por primera vez la cuestión de la "tapa", realizó una investigación detallada sobre las tumbas del estado de Wei y del estado de Wei, y también realizó etapas específicas para los bronces funerarios.
Durante el incidente del 7 de julio, la segunda excavación de Guo Baojun en el Pabellón Liulige en el condado de Huixian se vio obligada a detenerse. En la primavera de 1954, Guo Baojun presidió los trabajos de excavación en los suburbios occidentales de Luoyang. Aunque tiene más de 60 años, todavía va todos los días a la obra para dirigir la obra. Combinando documentos, fue pionero en la exploración por parte de la comunidad arqueológica de la ubicación de la "Ciudad Imperial" de Luoyang.