La Universidad Médica de Chongqing, conocida como "Universidad Médica de Chongqing", está establecida conjuntamente por la República Popular China, el Ministerio de Educación, la Comisión Nacional de Salud y el Gobierno Popular Municipal de Chongqing. seleccionado en el "Plan 111" nacional y en la "Construcción de Capacidad Básica de Ingeniería de las Universidades Centrales y Occidentales", "Programa de Educación y Capacitación de Doctores Excelentes".
Institución de becas del gobierno chino para estudiantes extranjeros, base nacional de educación de calidad cultural para estudiantes universitarios, base nacional de cooperación internacional en ciencia y tecnología, base de demostración para estudiar en China por parte del Ministerio de Educación, el primer lote de doctorados nacionales y unidades que otorgan títulos de maestría, Estación de Trabajo de Expertos Académicos de Chongqing. La unidad de construcción es la Universidad de Construcción de Disciplina de Primera Clase de Chongqing, una de las 14 universidades de la región occidental apoyadas por el estado.
La Universidad de Medicina de Chongqing se fundó en 1956. Fue fundado por el Shanghai First Medical College (ahora Fudan University Shanghai Medical College) y se trasladó a Chongqing. Originalmente se llamó Facultad de Medicina de Chongqing y pasó a llamarse Universidad Médica de Chongqing en 1985.
En 2008, el acuerdo de cooperación estratégica entre el Ministerio de Educación y la municipalidad de Chongqing designó a la escuela como una universidad clave. En junio de 2020, la escuela tiene dos campus, Yuanjiagang y Jinyun, con un área total de campus de 2650 acres, de los cuales el campus de Jinyun ocupa 2100 acres.