La Universidad de Medicina de Chongqing se fundó en 1956. Fue fundado por el Shanghai First Medical College (ahora Fudan University Shanghai Medical College) y se trasladó a Chongqing. Originalmente se llamó Facultad de Medicina de Chongqing y pasó a llamarse Universidad Médica de Chongqing en 1985. En 2008, el acuerdo de cooperación estratégica entre el Ministerio de Educación y la municipalidad de Chongqing designó a la escuela como universidad clave. Para 2022, la escuela tendrá dos campus, Yuanjiagang y Jinyun, con un área total de campus de 2,650 acres, de los cuales el campus de Jinyun cubre un área de 2,100 acres, hay una escuela de posgrado, 21 facultades (departamentos); y 36 carreras de pregrado.
El examen de ingreso de posgrado de la Universidad Médica de Chongqing es difícil. La Universidad de Medicina de Chongqing ocupa el puesto 63 entre las 100 mejores universidades del país, con un coeficiente de dificultad de admisión de 86,10, muy por encima de 50. Por lo tanto, el examen de ingreso de posgrado de la Universidad Médica de Chongqing es relativamente difícil. Disciplinas nacionales clave de la Universidad Médica de Chongqing: medicina interna (enfermedades infecciosas), pediatría, neurología, diagnóstico de laboratorio clínico; disciplinas de primer nivel de la Universidad Médica de Chongqing: medicina clínica, farmacia, medicina básica, ingeniería biomédica "Decimotercer Cinco" de la Universidad Médica de Chongqing; -Plan Anual” “Disciplinas clave: Biología, Ingeniería Biomédica, Medicina Básica, Medicina Clínica, Estomatología, Salud Pública y Medicina Preventiva, Medicina Tradicional China, Medicina Tradicional China y Occidental Integrada, Farmacia, Enfermería, Administración Pública, Estadística.