Después de un período de vacío de dos años y medio, se ha actualizado el mapa de la red de la línea terminal del Metro de Shenzhen. El 28 de junio de 2007, para cooperar con la estación de inspección del puerto de Futian inaugurada el 6 de agosto de 2007, se puso en funcionamiento la estación del puerto de Futian de la línea Longhua, poniendo fin a la historia de la operación de una sola línea y realizando la operación de doble línea. . Además, el ramal Lok Ma Chau del ferrocarril Kowloon-Cantón (ahora la línea ferroviaria este del ferrocarril de Hong Kong) conectado al puerto de Futian también inició operaciones a las 4:00 pm del 15 de agosto.
El 15 de agosto de 2008, el primer aniversario de la apertura del puerto de Futian, la estación Huanggang de la línea Longhua pasó a llamarse estación del puerto de Futian, lo que resolvió el problema de la confusión de pasajeros entre el puerto de Huanggang y el puerto de Futian.
Desde la apertura de la primera fase del Metro de Shenzhen, éste se encuentra en un estado de inactividad. Finalmente, el 28 de septiembre de 2009, la línea envolvente abrió tres estaciones más: Baishizhou, Gaoxin Park y Shenda. Aunque está a sólo unos kilómetros de distancia, ha entrado en una nueva zona: la zona del parque científico y tecnológico, lo que soluciona en cierta medida el problema de los desplazamientos de los empleados de las principales empresas de la zona.
A medida que se acerca la Universiada de 2011, las cinco líneas en construcción se han acelerado. En octubre de 2010, la Fase I de la Línea Shekou de 15 kilómetros (Chiwan-Ventana del Mundo) y la sección elevada de la Línea Longgang de 25 kilómetros (Shuanglong-Caopu) se pusieron en operación de prueba y fueron bien recibidas por el público. Esta es la primera vez que la línea Longlonggang llega al distrito de Longgang. El distrito de Longgang está ubicado fuera de la zona especial original y opera fuera de la red. Los pasajeros de otras líneas deben hacer transbordo a otros medios de transporte para llegar a las estaciones a lo largo de las líneas.
De acuerdo con el progreso de la construcción de la estación de tren Shenzhen Norte, está previsto que la segunda fase de la línea Longhua (Lianhua Norte-Qinghu) se inaugure el 6 de junio de 2011. Para entonces, los ciudadanos de Shenzhen podrán tomar esta línea desde la ciudad hasta la estación de tren de Shenzhen Norte y tomar el tren de alta velocidad a Guangzhou, Changsha, Wuhan, Xiamen y otros lugares. Además, esta línea facilitará enormemente los desplazamientos de los residentes de la zona de Longhua.
Se puede decir que 2011 será un año de crecimiento explosivo para el Metro de Shenzhen. El 30 de junio de 2011 se pusieron en funcionamiento la Línea Central, la Línea Longgang (Shuibei-Yitian) y la Línea Envolvente (Taoyuan-Aeropuerto Este), logrando los objetivos fijados para el año. Sin embargo, la segunda fase de la Línea Shekou (Qiaocheng Norte-Xinxiu) puede retrasarse un mes por motivos de construcción.
Según los datos de los billetes conmemorativos emitidos para el proyecto Shekou Line Phase I, el 28 de julio de 2011, el último tramo del proyecto Shenzhen Rail Transit Phase II - Shekou Line Phase II (Qiaocheng Norte- Xinxiu) Puesta en funcionamiento. Hasta ahora, se han puesto en funcionamiento los 155 kilómetros del Proyecto de Tránsito Ferroviario de Shenzhen Fase II. Para entonces, el Metro de Shenzhen, que se extiende en todas direcciones, atravesará múltiples grandes centros de transporte y áreas residenciales, y conectará múltiples ciudades satélite, llevando el transporte de Shenzhen a un nuevo nivel.