Desde pequeño, Newton no se llevaba bien con los niños a los que les gustaba andarse con rodeos. Le gusta pensar tranquilamente, le gusta inventar y es muy bueno haciendo manualidades. Sus molinos de viento, cometas y relojes de sol eran muy delicados, por eso todos lo llamaban "el pequeño artesano".
En la escuela secundaria, Newton ingresó en la Grantham Royal School, a una docena de kilómetros de casa, y se alojó con la familia del farmacéutico Clark. La farmacia en aquella época era como un pequeño laboratorio de química, donde Newton aprendió muchos conocimientos de química y desarrolló su amor por la ciencia.
A los 14 años, la situación familiar de Newton se deterioró y tuvo que abandonar la escuela y volver a casa a trabajar en la granja. Afortunadamente, el director de Grantham y su tío valoraron el genio de Newton y creyeron que debía continuar su investigación. Después de su repetida persuasión, la madre de Newton le permitió empezar a estudiar de nuevo.
En 1661, Newton fue admitido en el Trinity College de la Universidad de Cambridge en nombre de la exención de matrícula. Los llamados estudiantes con tarifa reducida equivalen al actual programa de estudio y trabajo. Obtienen becas trabajando para profesores e investigadores científicos de la universidad.
En el segundo año después de la admisión de Newton, el Trinity College estableció la Conferencia Lucas, dedicada a la enseñanza del conocimiento de las ciencias naturales. El primer profesor de esta conferencia fue Barrow, miembro de la Royal Society y un gran matemático. Newton consideraba a Barrow el maestro más útil de su vida. Fue él quien introdujo a Newton en las ciencias naturales modernas, especialmente la óptica y las matemáticas. Barrow admiraba e incluso reverenciaba a sus alumnos favoritos. A menudo decía: "Aunque tengo algunos logros en matemáticas, en comparación con Newton, soy sólo un niño". Más tarde, Barrow tomó la iniciativa de ceder la cátedra de la Lucas Lecture a Newton, dejando que Newton, de 26 años, se convirtiera en el. Se convirtió en profesor.
De 1665 a 1667, una terrible plaga se produjo en Inglaterra. Sólo en Londres, 30.000 personas murieron a causa de la peste en el verano de 1665. La Universidad de Cambridge tuvo que suspender las clases y todos se dispersaron hacia el campo escasamente poblado. Newton también se refugió en su ciudad natal de Woolsthorpe.
Los dos años en Woolsop fueron el período más creativo de la vida de Newton. El propio Newton dijo una vez que las ideas básicas de muchos de sus principales estudios se formaron en estos dos años y sólo se desarrollaron y mejoraron más tarde. Fue durante estos dos años cuando descubrió el cálculo, la composición de la luz blanca y la famosa ley de la gravitación universal.