En ese momento, había diez universidades dependientes del Ministerio de Ferrocarriles, que fueron entregadas al Ministerio de Transporte o a los gobiernos locales durante la reforma del año 2000. Ahora siguen siendo la mejor escuela en la industria del transporte ferroviario.
La primera es la Universidad Jiaotong del Suroeste y la Universidad Jiaotong de Beijing, ambas 211 universidades. Aunque ahora no es una universidad de doble primera clase, sigue siendo una universidad de construcción de disciplinas de doble primera clase. Sin embargo, la Universidad Jiaotong de Beijing fue seleccionada como una disciplina doble de primera clase en ciencia de sistemas, y la Universidad Jiaotong del Suroeste fue seleccionada como una disciplina doble de primera clase en ingeniería de transporte.
También hay tres universidades originales 985 que ahora están seleccionadas como universidades dobles de primera clase, a saber, la Universidad Central Sur, la Universidad Tongji y la Universidad del Sureste. Sin embargo, después de la fusión y reorganización, se convirtieron en universidades integrales. Sin embargo, la Universidad Central Sur y la Universidad Tongji conservaron la especialización en tránsito ferroviario, especialmente la Universidad Central Sur, que también conservó la Escuela de Ferrocarriles. Ponerlos en esta posición se debe principalmente a que su amplia experiencia es de primer nivel.