Ma Yinan es la hermana mayor de Ma Ying-jeou. Su hogar ancestral está frente al templo Majiayan, ciudad de Baishi, condado de Xiangtan, provincia de Hunan. Según los registros genealógicos, es descendiente de Ma Yuan. , un general famoso de la dinastía Han del Este. Se mudó a Xiangtan desde Jiangxi a principios de la dinastía Ming. Ma Yinan es el mayor de la familia y Ma Ying-jeou es el cuarto. Ma Yinan ha amado mucho a su hermano menor, Ma Ying-jeou, desde que era un niño.