El escenario principal del Proyecto Kagero está cerca de la residencia de Jin, en la ciudad de Kashiwa, prefectura de Chiba.
Volumen 1
El 14 de agosto, Shintaro Kisaragi, un niño que vive en casa, provocó un mal funcionamiento de su teclado y mouse debido a la broma de la chica informática ENE (Ene) quien Vivía en su computadora. Detuvo su misión de seguridad en el hogar de dos años para comprar reemplazos y salió con ENE. Desafortunadamente, estuvo involucrado en un incidente planeado por terroristas en una tienda departamental. Por otro lado, la hermana de Shintaro Kisaragi, el popular ídolo Momo Kisaragi, también se encuentra en el dilema de escapar de la multitud loca y se encuentra con el líder del grupo Mekakudan que tiene la capacidad de taparse los ojos. Momo Kisaragi, que está preocupada por su capacidad para atraer la atención, se une al Mekakakudan porque cree que Kido, el líder del Mekakudan, tiene la capacidad de curar su cuerpo. Debido a que el error de Jasmine provocó que el teléfono móvil de Kisaragi Tao funcionara mal, Kido usó su habilidad para coordinarse con varias personas para ir a los grandes almacenes y se encontró con un incidente. El incidente se resolvió con la cooperación de todos en el grupo Mekakure y las acciones de Shintaro Kisaragi y ENE, y luego Shintaro Kisaragi se unió al grupo.
Después de eso, todos los miembros del grupo Mekakure llegaron al parque de diversiones de arriba. Después de que todo terminó, se encontraron con un grave accidente automovilístico en la carretera (es decir, se encontraron con Amamiya Kyoya y Asahina Hiyori. Ene vio al chico de pelo blanco al costado de la carretera y no pudo evitar soltar: "KONOHA...). "
Volumen 2
Durante el aniversario de la escuela secundaria, la historia de Enomoto Takaine y Kuno Yoriharu quienes pertenecen a la clase especial. El tutor, Kenjiro Toyama, fue obligado a hacerse cargo del programa de juegos de batalla de disparos que forma parte del aniversario de la escuela porque utilizó fondos proporcionados por la escuela para comprar artículos personales.