Los documentos históricos antiguos de Japón, como las "Crónicas antiguas" y los "Diarios", tienen descripciones detalladas de los baños termales del emperador. Se puede ver que los japoneses han aprendido a hacerlo desde hace mucho tiempo. utilizar aguas termales.
Durante el período Nara, debido a la introducción del budismo, se construyeron templos por todas partes y el baño de los monjes jugó un gran papel en la promoción del desarrollo de aguas termales. En aquella época ya se habían descubierto las propiedades curativas de las aguas termales.
Los registros "Yewanki" del período Heian de las aguas termales de Yugawara en la prefectura de Kanagawa y de las aguas termales de Kamiyamada en la prefectura de Nagano indican que las aguas termales del este también se han desarrollado. Las aguas termales en aquella época eran utilizadas principalmente para el ocio, el tratamiento y diversas actividades religiosas por parte de nobles y monjes. Las aguas termales en aquella época tenían una profunda conexión con la religión. Después de que la dinastía Genrai estableció el shogunato Kamakura y trasladó la capital de Kioto a Kamakura, las aguas termales de Tokai, Tohoku y Koshishin comenzaron a aparecer en documentos históricos, y los monjes enfermos acudían a las aguas termales de varios lugares para recibir tratamiento.
Durante el período Muromachi, las aguas termales se convirtieron en un lugar de ocio y entretenimiento para dignatarios y otras personas y no estaban abiertas al público en general. En el período Antu Taoshan, las aguas termales se habían utilizado ampliamente para tratar a los soldados heridos, especialmente en Jiazhou y Xinzhou. Los generales de los Estados en Guerra como Takeda Shingen y Sanada Yukimura tenían sus propias "fuentes termales secretas".
En el período Edo moderno, debido a que la medicina no estaba muy desarrollada, el efecto médico de las aguas termales se tomó en serio y se desarrolló en gran medida. Durante este período, la terapia de aguas termales no sólo fue popular entre los generales y celebridades, sino que también el público en general comenzó a disfrutar de las aguas termales.