Generalmente, este tipo de oraciones se pueden decir de manera casual, como ¿Cómo está el tiempo mañana?
De las dos oraciones que diste, la segunda es gramaticalmente correcta.
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Lo que dijiste después es incorrecto. Las preguntas de las cláusulas deben estar en orden declarativo. Debería ser:
¿Puedes decirme cómo estará el tiempo?