En la Copa del Mundo de 1998 en Francia, Japón, que ingresó a la Copa del Mundo por primera vez, estaba en el mismo grupo que Argentina, Croacia y Jamaica, y perdió. los tres juegos.
En el Mundial Corea-Japón 2002, el segundo equipo japonés entró entre los 16 primeros y perdió ante Türkiye por 0-1.
En el Mundial de Alemania 2006, estuvo en el mismo grupo que Brasil, Croacia y Australia 1. Quedaron eliminados en la fase de grupos.
En el Mundial de Sudáfrica 2010 quedó clasificado en un grupo junto a Holanda, Dinamarca y Camerún. Sólo perdió ante Holanda en la fase de grupos, avanzó a octavos de final y perdió ante Paraguay en los penales.
En el Mundial de Brasil 2014, quedó clasificado en un grupo con Colombia, Grecia y Costa de Marfil. Fueron eliminados en la fase de grupos, perdiendo dos y empatando uno en tres partidos.
En el Mundial de Rusia 2018, junto a Colombia, Senegal y Polonia, avanzó hasta el puesto 16 y perdió ante Bélgica por 2-3.
Copa Mundial de la FIFA Qatar 2022 La selección de Japón volvió a detenerse en el Mundial 16.
El jugador principal de la selección japonesa en la Copa Mundial de la FIFA Qatar 2022 en 2022.
Porteros: Eiji Kawashima, Shuichi Gonda y Daniel Schmidt.
Guardias: Yuta Nakayama, Kenyo Fukugan, Nagatomo Utō, Maya Yoshida, Hiroki Sakai, Akigo Taniguchi, Itakura_, Yoki Ito.
Centrocampista: Daichi Kamada, Takeshi Shibasaki, Hideo Endo, Minori Yamane, Mizun, Anlu Tang, Aoe Tanaga, Hide Kubo, Nagakichi Sōma, Yumasa Kotobuda.
Delanteros: Keiji Ueda, Shunya Ito, Takumi Minamino, Takuma Asano Nagamaki, Tatsuro Maeda.