En el octavo año de Keicho (1603), Tokugawa Ieyasu fue nombrado shogun extranjero y estableció el shogunato en Edo (hoy Tokio). Posteriormente, la familia Tokugawa gobernó el país durante más de 260 años. Este período se conoce como período Edo. El shogunato Tokugawa controlaba estrictamente al emperador, los nobles, los templos y los santuarios, y hacía todo lo posible por gobernar a los campesinos que apoyaban el sistema mobi. En el noveno año de Yuanhe (1623), el general de tercera generación de la familia Tokugawa, Tokugawa Hiroka, llegó al poder y ordenó el cierre del país. Los extranjeros tienen prohibido venir a Japón y los japoneses tienen prohibido viajar al extranjero, excepto Nagasaki y las zonas fronterizas, que están abiertas como puertos extranjeros. Debido al trabajo a puerta cerrada, el sistema Mufan ha marcado el comienzo de un período de estabilidad. Sin embargo, con el desarrollo de la industria y la economía mercantil, el sistema de gestión autosuficiente de los agricultores colapsó y el sistema del shogunato comenzó a tambalearse en el siglo XVIII.
La cultura popular es la característica de este período. Desde finales del siglo XVII hasta principios del siglo XVIII, la cultura Luyuan fue una cultura samurái y mercantil centrada en Kioto y Osaka (los lugareños de Kanto, Japón, llamaban a Kioto y Osaka la cima). El vidrio de muñeca, el kabuki, el ukiyo-e, las pinturas de los literatos, etc. presentan una cultura mercantil rica y colorida.