Durante el período Muromachi, tanto la cultura aristocrática como los artistas marciales fueron influenciados por el budismo zen. A finales del siglo XIV, la cultura Beishan representada por el templo Jingu y la cultura Dongshan representada por el templo Yinta estaban muy desarrolladas. A mediados del siglo XVI, los portugueses y españoles llegaron a Japón e introdujeron las armas y el cristianismo. Fue una época culturalmente activa.
Tsunshi estableció la Dinastía del Norte correspondiente a la Dinastía del Sur en Godaigou, y estableció el Shogunato Muromachi en 1336. El período de oposición entre las dos dinastías, las Dinastías del Sur y del Norte, duró hasta 1392 d.C., cuando finalmente fue unificado por las Dinastías del Norte. Aprovechando el levantamiento de Ren Ying como una oportunidad, Japón entró en el Período de los Reinos Combatientes. Aunque la guerra continuó, el comercio interior y exterior floreció y la tecnología agrícola e industrial mejoró. Al mismo tiempo, los japoneses atacaron a Corea y China.