La predecesora de la 59.ª División fue la 10.ª Brigada independiente.
El 2 de febrero de 1942, se amplió a la 59.ª División en Jinan. Afiliado al 12º Ejército.
El primer comandante de división fue el teniente general Yanagawa Tsutomu (16 de abril de 1942)
En marzo de 1945, el teniente general Fujita Shigeru se convirtió en el último comandante de división.
La 59.ª División alguna vez estuvo afiliada al 43.º Ejército.
En junio de 1945, recibió una orden y fue transferido al ejército de Kwantung. A principios de julio, se subió al tren en Jinan y se dirigió a Hamhung, Corea del Norte. Afiliado al 34º Ejército. El 20 de agosto fue perseguido por las tropas mecanizadas del Ejército Rojo soviético y desarmado. Algunas de las tropas fueron escoltadas a trabajar en Siberia.
El comandante de división Fujita Shigeru, el comandante de brigada Nagashima Tsutomu, Kamita Katsu y otros fueron posteriormente entregados a China.
La 59.ª División tuvo dos comandantes de división antes y después
El primero fue Yanagawa Tsutomu
El segundo fue Fujita Shigeru