Lo anterior es la estructura del núcleo celular. La razón por la que el núcleo celular se puede teñir es por la presencia de cromatina.
Las vacuolas son estructuras parecidas a burbujas en el citoplasma. La vacuola es un orgánulo compuesto por una sola membrana y el líquido celular en su interior, que se encuentra principalmente en las células vegetales. A las vacuolas también pertenecen las vacuolas alimentarias y las vacuolas de contracción de los animales inferiores, especialmente los unicelulares. El exterior está separado del citoplasma por la membrana de la vacuola y el interior contiene citosol acuoso. Las células vegetales jóvenes tienen vacuolas pequeñas, mientras que las células vegetales maduras tienen vacuolas grandes. El color de las flores, hojas y frutos, excepto el verde, se produce principalmente por el color del líquido celular de la vacuola.