No creo que haya ninguna diferencia.
Estar profundamente arraigado significa: echar raíces, estar arraigado.
Tomemos como ejemplo las orquídeas: la plantación profunda requiere mayores requisitos de material vegetal, especialmente holgura y ventilación, porque las cabezas de los juncos de las orquídeas están debajo del suelo, y si la ventilación no es buena, será muy difícil. Difícil de germinar. Plantar material de siembra que no esté lo suficientemente suelto conducirá a dos extremos: uno es que el agua no se drene, provocando acumulación de agua y los cogollos se pudrirán. El otro es que cuando el material de siembra esté seco, puede endurecerse, provocando que la orquídea. cogollos para asfixiarse.