En abril de 1949, Li Shouxin huyó a Taiwán. En junio, Li Shouxin regresó a Mongolia Interior desde Taiwán y siguió al Rey De para participar en la organización del "Gobierno Autónomo de Mongolia" en Alxa Banner. Después de la liberación pacífica de Alxa Banner, huyó a Mongolia. Fue arrestado por el Ejército Popular de Liberación de Mongolia y el Ejército de la Guardia Fronteriza el 27 de febrero de 1950. Fue extraditado a China el 18 de septiembre de ese año y encarcelado en Beijing. Fue indultado por el Gobierno Popular en 1964. Posteriormente se desempeñó como bibliotecario del Museo de Cultura e Historia de la Región Autónoma de Mongolia Interior y escribió una memoria de 300.000 palabras.
En mayo de 1970, Li Shouxin murió de una enfermedad en Hohhot a la edad de 78 años.