La primera reserva natural en la provincia de Guizhou fue aprobada en 1978.
En 1986, el Consejo de Estado lo aprobó como reserva natural nacional. Ese mismo año, con la aprobación del Director Coordinador Internacional para el Hombre y la Biosfera de la UNESCO, fue admitida como miembro de la Red Mundial de Áreas Protegidas MAB y se convirtió en la cuarta reserva internacional de biosfera de China.
En 1989, el Gobierno Popular Provincial de Guizhou cambió oficialmente el nombre de la antigua Reserva Natural Fanjingshan en Tongren, provincia de Guizhou, como "Reserva Natural Nacional Guizhou Fanjingshan" con el documento "Qianfutong No. 8913".