El condado es la Prefectura Autónoma Hui de Changji en la Región Autónoma Uygur de Xinjiang.
Se encuentra al pie norte de las montañas Tianshan y en el borde sureste de la cuenca Junggar. El condado de Mulei está situado a 270 kilómetros al este de Urumqi, la capital de la Región Autónoma Uygur de Xinjiang, y a unos 270 kilómetros de Urumqi. Es adyacente al condado de Barkol al este, al condado de Qitai al oeste, al otro lado de las montañas del condado de Shanshan y limita con Mongolia al norte. El condado de Mulei tiene una superficie total de aproximadamente 13.500 kilómetros cuadrados, con 4 ciudades, 7 municipios, 60 aldeas administrativas y 7 comunidades bajo su jurisdicción.