¿Es el sitio p ribosómico un sitio de unión de codones?

Sí,

La función principal de los ribosomas es convertir el código genético en secuencias de aminoácidos y construir polímeros proteicos a partir de monómeros de aminoácidos. El ARNm contiene una serie de codones que los ribosomas decodifican para producir proteínas. Utilizando el ARNm como plantilla, el ribosoma funciona moviéndose a través de cada codón (3 nucleótidos) del ARNm, emparejándolo con el aminoácido apropiado proporcionado por el aminoacil-ARNt. El aminoacil-ARNt contiene un anticodón complementario al codón en un extremo y el aminoácido apropiado en el otro extremo. Los ribosomas utilizan grandes cambios conformacionales para identificar de forma rápida y precisa el ARNt apropiado [6]. La subunidad ribosomal pequeña, que normalmente se asocia con aminoacil-ARNt que contiene el primer aminoácido metionina, se une al codón AUG y recluta la subunidad ribosómica grande. Los ribosomas contienen tres sitios de unión de ARN: sitios A, P y E. El sitio A se une al aminoacil-ARNt o al factor de liberación del terminador [7]; el sitio P se une al peptidil-ARNt (el ARNt unido a la cadena polipeptídica del ARNt se une al ARNt libre); La síntesis de proteínas comienza con el codón de iniciación AUG cerca del extremo 5' del ARNm. El ARNm se une primero al sitio P del ribosoma. Los ribosomas reconocen el codón de inicio utilizando la secuencia Shine-Dalgarno de ARNm en procariotas y la caja Kozak en eucariotas.

Plegamiento de traducción

Los ribosomas participan activamente en el plegamiento de proteínas [8]. En algunos casos, los ribosomas son fundamentales para la obtención de proteínas funcionales. Por ejemplo, el plegamiento de proteínas profundamente anudadas se basa en que los ribosomas empujan las cadenas a través de bucles adjuntos [9].

Añadir aminoácidos independientes de la traducción

La presencia de la proteína de control de calidad ribosómica Rqc2 se asocia con la extensión independiente del ARNm de las cadenas polipeptídicas de proteínas [10]. Este alargamiento es el resultado de que el ribosoma agregue una cola CAT al ARNt traído por Rqc2.

Transferencia de peptidilo e hidrólisis de peptidilo

Los ribosomas desempeñan un papel catalítico en dos procesos biológicos extremadamente importantes: la transferencia de peptidilo y la hidrólisis de peptidilo.

Clasificación

Ribosomas bacterianos

El ribosoma bacteriano 70S está compuesto por la subunidad pequeña 30S y la subunidad grande 50S. La subunidad pequeña 30S contiene ARN 16S (1540 nucleótidos) y 21 proteínas ribosomales; la subunidad grande consta de ARN 5S (120 nucleótidos), ARN 23S (2900 nucleótidos) y 31 proteínas ribosomales. Composición[5].

Ribosomas eucariotas

Ribosomas eucariotas Los ribosomas 80S se encuentran situados en su citoplasma. Cada ribosoma está compuesto por la subunidad pequeña 40S y la subunidad grande 60S. La subunidad 40S tiene ARN 18S (1900 nucleótidos) y 33 proteínas [11][12]. La subunidad grande 60S está compuesta por ARN 5S (120 nucleótidos), ARN 28S (4700 nucleótidos), ARN 5,8S (160 nucleótidos) y 46 proteínas ribosómicas [5][11][12].

ribosomas mitocondriales y ribosomas de plástidos

En los eucariotas, los ribosomas situados en las mitocondrias se denominan ribosomas mitocondriales (mitoribosomas), y los ribosomas situados en el plástido se denominan plastoribosomas, como por ejemplo ribosomas cloroplásticos ubicados en los cloroplastos. También son un ribosoma 70S compuesto de subunidades grandes y pequeñas combinadas con proteínas, similar a las bacterias [5]. De los dos, los ribosomas del cloroplasto están más cerca de las bacterias que los ribosomas mitocondriales. Muchos ARN ribosómicos en las mitocondrias se acortan y su ARNr 5S es reemplazado por otras estructuras en animales y hongos [13].

Los químicos medicinales utilizan las diferencias entre los ribosomas bacterianos y eucariotas para crear antibióticos como aminoglucósidos, antibióticos de tetraciclina y otros inhibidores de la síntesis de proteínas para destruir específicamente las infecciones bacterianas. Debido a sus diferencias estructurales, los ribosomas 70S bacterianos son susceptibles a estos antibióticos, mientras que los ribosomas 80S eucariotas no lo son [14]. Aunque las mitocondrias tienen ribosomas similares a las bacterias, estos antibióticos tampoco las afectan porque están rodeadas por una doble membrana y no pueden llevar fácilmente estos antibióticos al orgánulo [15]. Lo mismo ocurre con los cloroplastos [16].

Ribosomas libres

Los ribosomas libres pueden desplazarse a cualquier parte del citoplasma, pero están excluidos del núcleo y otros orgánulos. Las proteínas producidas a partir de ribosomas libres se liberan en el citoplasma y se utilizan dentro de la célula. Dado que el citoplasma contiene altas concentraciones de glutatión, es un ambiente reductor y, por lo tanto, los ribosomas libres en el citoplasma no pueden producir proteínas que contengan enlaces disulfuro formados a partir de residuos de cisteína oxidados.

Ribosomas unidos a membranas

Los ribosomas pueden asociarse a las membranas cuando comienzan a sintetizar proteínas requeridas por ciertos orgánulos. En las células eucariotas, esta unión se produce en el retículo endoplasmático rugoso (RE). Los ribosomas insertan cadenas polipeptídicas recién generadas directamente en el RE y luego estas cadenas polipeptídicas se transportan a su destino a través de la vía secretora. Las proteínas producidas por ribosomas unidos a membranas normalmente se utilizan dentro de la membrana plasmática o se excretan de la célula mediante exocitosis [17].