Además de tener un acuerdo de libre comercio con la UE, la Alianza también coopera con otras partes del mundo en diferentes campos. Actualmente, la Alianza tiene acuerdos de libre comercio con 20 países y, junto con los 27 países de la UE, la UE no tiene restricciones comerciales con 47 países.
EFTA sigue costumbres tradicionales y clasifica a los países no pertenecientes a la UE como terceros países. La cuestión de la relación de la AELC con terceros países se originó en 1967, cuando los países de la AELC en su conjunto establecieron una relación de cooperación con la ex Yugoslavia mediante el establecimiento de un grupo de trabajo conjunto. En 1983, las relaciones entre la AELC y Yugoslavia se formalizaron más mediante la llamada (primera) Declaración de Bergen y el establecimiento del Comité Conjunto AELC-Yugoslavia. Este comité se reunió anualmente hasta la desintegración de Yugoslavia.
EFTA firma el primer acuerdo de libre comercio con España como organización unificada. Con el fin de completar el sistema de libre comercio europeo y permitir que los exportadores de los países de la AELC reciban el mismo trato que los países europeos cuando realicen transacciones en España, en 1979 se firmó el Tratado de Libre Comercio entre la AELC y España, con efectos a partir del 1 de mayo de 1980. Entra en vigor . El acuerdo quedó suspendido después de que España se uniera a la Unión Europea el 31 de diciembre de 1985. La relación comercial entre España y la AELC está determinada por los acuerdos bilaterales de libre comercio alcanzados por cada país miembro de la AELC y la Unión Europea.