Zexal es completamente independiente, básicamente no hay pistas que lo conecten con los tres primeros. La homología de 5ds no menciona la historia negra, por lo que puede considerarse como una visión del mundo independiente.
Aunque la configuración de fondo de arcv es la misma que la de las tres primeras partes, no se puede confirmar que sea la trama de seguimiento de las tres primeras partes. Los escenarios en la dimensión sincrónica actual son diferentes a los de 5ds. Se parece más a un simple escenario prestado que a una secuela.