El primer presidente del club fue el el farmacéutico José Calduch Almela, el empleado de banco José Martínez Aguilar sirve como secretario.
También forman parte de la primera junta directiva Carlos Calatayud Jordá, Juan Nebot, Alfonso Saera, Manuel Calduch, Pascual Arrufat Catalá, Vicente Cabedo Meseguer y Manuel Amorós Fortuno.
El 24 de abril de 1923, la junta directiva del club tomó su primera decisión: alquilar el estadio a un precio de 60 pesetas mensuales y vender entradas al público. Las entradas cuestan 0,5 pesetas para hombres adultos, mitad de precio para niños y gratis para mujeres.
En esta reunión de la directiva, la directiva decidió por unanimidad el color de la primera camiseta del equipo: una camiseta blanca con pantalón negro. Al mismo tiempo, este esquema de color también se convirtió en el primer color del logotipo del Villarreal Club, extendiéndose hasta 1946. Más tarde se cambió a la familiar combinación de amarillo y azul. El 17 de junio de 1923 se inauguró el Estadio del Villarreal. Los equipos que acudieron a felicitar la finalización fueron el C.D. Castellón y el Cervantes, los dos equipos más importantes de la capital provincial de Delaplan.
1923 El 21 de octubre, el Villarreal jugó su primer partido en el nuevo estadio: un partido amistoso contra el Estrella Roja. El primer momento importante en la historia del club Villarreal se produjo en la temporada 1934-1935: el equipo tuvo la oportunidad de ascender a segunda división (que en ese momento no existía) tras un partido con el Cartagena Fútbol Club. división y la tercera división, la división regional es la segunda división). Es una pena que el equipo haya perdido el partido y no haya podido avanzar.
Un año después, el Villarreal se proclamó campeón autonómico. Lamentablemente aún más, estalló la Guerra Civil Española y todas las competiciones deportivas se vieron obligadas a paralizarse. Tras el final de la Guerra Civil Española, el fútbol volvió al Estadio Adagio.
El Villarreal jugó en Segunda División autonómica desde 1939 hasta 1950. Al finalizar la temporada 1950-51, el equipo ascendió a la Liga Regional A.
Década de 1950
De 1952 a 1956, el Villarreal permaneció en la Liga Regional A, terminando cuarto dos veces y séptimo una vez. En 1956, el equipo ganó el campeonato de liga regional de primer nivel y ascendió a la liga nacional de tercer nivel. En 1961, el equipo ocupó el puesto 14 en la Conferencia Oeste, volviendo a caer a la cima de la región.
Década de los 60
El Villarreal, que descendió a la categoría autonómica, luchó por el ascenso en las dos temporadas que transcurrieron desde 1961 hasta 63. Lo que hace reír o llorar a la gente es que el equipo acaba de terminar tercero dos veces y se perdió el ascenso.
En la temporada 1966-67, los chicos no perdieron la oportunidad de avanzar: ganaron el campeonato de liga regional y ascendieron con éxito. En las siguientes temporadas, el Villarreal se afianzó en la tercera división y ascendió por primera vez a la segunda división del fútbol español en 1970.
Década de 1970
La década de 1970 fue una década triste para este equipo. En la primera temporada del Oeste B, los Submarinos Amarillos apenas completaron la tarea de descenso; en el segundo año, la buena suerte ya no llegó: el equipo ocupó el puesto 17 en el Oeste B y cayó al tercer lugar en la liga. En los años siguientes, Villarreal deambuló por la zona media y baja de España y China.
El equipo descendió a la liga autonómica en la temporada 1975-76. Afortunadamente, después de este descenso, el equipo ascendió y regresó al West Ice esta temporada, donde permaneció hasta mediados o finales de la década de 1980.
Década de 1980
El equipo se estabilizó alrededor del Mundial de 1982 en España y mantuvo su sede en el Oeste C hasta la temporada 1986-87. Después de la temporada, ascendió con éxito al Grupo B. de Oeste B.
Durante los dos años siguientes, el Villarreal se mantuvo en los primeros puestos del Grupo B de la Segunda División española, pero el descenso llegó en la temporada 1989-90. Al final de la temporada, el equipo ocupó el puesto 18 y volvió a caer al Oeste C.
Década de los 90
En la temporada 1990-91, el equipo volvió a avanzar al Grupo B de la Segunda División Española. La pasada temporada, el equipo acabó segundo del Grupo B de España y se clasificó para la Liga Española de Fútbol B, completando el "doble salto". El Villarreal está en la Serie B desde la temporada 1992-93. Tras varios años de transición, poco a poco ha ido entrando en los primeros puestos de la clasificación.
Al final de la temporada 1997-98, el equipo ocupó el cuarto lugar en West B y ganó el último lugar para participar en los play-offs de ascenso. El partido de ida acabó con empate a cero ante el Compostela Fútbol Club en el madrigal.
El 24 de mayo de 1998 se disputó la segunda vuelta en el Estadio San Lázaro de Compostela. Alberto anotó un gol de valor inestimable para el Villarreal para sellar el marcador global en 1-1, haciendo de este un día trascendental en la historia del club.
Después de tres cuartos de siglo de altibajos, el Submarino Amarillo por fin accedió a la Liga Española de Fútbol. El 31 de agosto de 65438, el Villarreal jugó su primer partido de La Liga contra el Real Madrid repleto de estrellas en el Estadio Bernabéu. Una semana después, el Estadio da Estadio abrió sus puertas a los rivales de La Liga, y el primer visitante fue Vigo Ceta. En esa temporada histórica, aunque el equipo tuvo un comienzo fantástico, toda la temporada no fue ideal. El Submarino Amarillo perdió en los play-offs de descenso al final de la temporada y regresó a Segunda División, pero este viaje a Segunda División duró sólo un corto año.
En la temporada entre siglos, el equipo terminó tercero en La Liga y regresó a La Liga. Al año siguiente, Villarreal increíblemente terminó la temporada en el séptimo lugar de la liga. Pero en las dos temporadas siguientes (2001-03), el equipo sólo ocupó el puesto 15 y estuvo al borde del descenso.
En el verano de 2003, el Villarreal ganó su primer trofeo europeo, la final de la Copa Intertoto, derrotando al Heerenveen de Holanda para ganar el trofeo. Esta fantástica victoria metió al equipo por primera vez en la Copa de la UEFA. Desde entonces, la actuación del equipo una vez más conmocionó al mundo. El Submarino Amarillo llegó hasta las semifinales de la Copa de la UEFA y toda Europa sintió la poderosa energía que emanaba de este equipo de pequeña ciudad del Mediterráneo. El Villarreal acabó octavo en La Liga en la temporada 2003-04, a sólo un paso de clasificarse para la Copa de la UEFA la próxima temporada. El Villarreal estaba ascendiendo rápidamente y había una vaga sensación de que iban a suceder grandes cosas para este pequeño equipo, ¡y así fue!
En la temporada 2004-05, el Submarino Amarillo ocupó el tercer lugar en La Liga con unos increíbles 65 puntos, sólo superado por los dos gigantes Barcelona y Real Madrid. Este increíble resultado proviene del espíritu de equipo acumulado del equipo y la fuerte incorporación de la fenomenal máquina de goles: Diego Forlán. 25 goles esa temporada le valieron al delantero uruguayo la Bota de Oro europea. Esa temporada volvió a alcanzar los cuartos de final de la Copa de la UEFA.
El tercer puesto en La Liga permitió al equipo entrar en la competición más importante del mundo del fútbol: la Liga de Campeones de la UEFA. El Submarino Amarillo accedió a la fase de grupos de la Liga de Campeones después de derrotar por partida doble al Everton de la Premier League en la ronda de clasificación. Luego, en la fase de grupos, el equipo derrotó al gigante de la Premier League, el Manchester United, para ingresar a la ronda eliminatoria de la Liga de Campeones como el primer lugar del grupo. Los milagros continúan y el equipo hace historia con cada paso adelante. Este equipo, que todavía luchaba en la cuarta liga española hace 16 años, eliminó a dos equipos famosos, el Glasgow Rangers y el Inter de Milán, y llegó a las semifinales de la Liga de Campeones de una manera impactante.
Sin embargo, tras dos jornadas de partidos contra el Arsenal Football Club, el motor del Submarino Amarillo dejó de funcionar y el equipo se paró en las semifinales de la Liga de Campeones. Aun así, no hay palabras amables para describir este glorioso viaje.
El sueño quedó temporalmente en suspenso, pero no terminó.