En el 32ABY (abreviatura de Before the Battle of Yavin, es decir, antes de la Batalla de Yavin), era un aprendiz Jedi de 25 años que estudiaba con el Maestro Jedi Qui-Gon Jinn.
De acuerdo con las órdenes de Valoran, Canciller Supremo de la República Galáctica, Obi-Wan y el Maestro partieron en secreto hacia el hermoso planeta Naboo para llevar a cabo negociaciones para resolver pacíficamente el conflicto de la Federación de Comercio con Naboo. . Después de abordar la estación espacial de la Federación de Comercio, los astutos neimoidianos de repente les tendieron una trampa y trataron de matarlos. Kenobi y su maestro escaparon sanos y salvos, se escondieron en la nave espacial de la Federación de Comercio que invadió Naboo y aterrizaron en Naboo. Cuando surgió la conspiración que rodeaba la Batalla de Naboo, Obi-Wan navegó desde Naboo con su maestro a través de Tatooine hasta Coruscant, y luego regresó a Naboo. Obi-Wan se sorprendió cuando Qui-Gon llevó a un joven, Anakin Skywalker, un esclavo Tatooine liberado, al Consejo Jedi para realizar pruebas. Qui-Gon afirma que Anakin es el Elegido según las antiguas profecías Jedi y que reemplazará a Obi-Wan como nuevo aprendiz de Jin. El Consejo rechazó la solicitud de Qui-Gon de entrenar al niño.
Esta fue solo una de las muchas disputas entre Obi-Wan Kenobi y Qui-Gon Jinn. King, un hombre que creía que la Fuerza viva era más importante que la Fuerza Única estática, había sido visto durante mucho tiempo por el Consejo como un disidente que había perdido el rumbo. Obi-Wan rogó repetidamente al Maestro que no se enfrentara al Consejo Jedi, pero Qui-Gon siempre respondía: debe hacer lo que la Fuerza quiere. Mientras liberaban a Naboo, Qui-Gon y Obi-Wan fueron desafiados por un temible Lord Sith. Los Sith eran una amenaza olvidada que reapareció cientos de años después de que se los creyera muertos. Jedi y Sith se enfrentaron en un duelo con sables de luz por primera vez en muchas generaciones. Darth Maul usó su increíble velocidad, su feroz espíritu de lucha y su sable de luz de doble filo para luchar contra dos Caballeros Jedi. A medida que avanza el duelo, Obi-Wan y Qui-Gon están separados por una puerta mosquitera. Obi-Wan solo pudo observar impotente cómo Maul mataba a Qui-Gon. Cuando llegó su turno de actuar, Obi-Wan corrió hacia adelante y comenzó una feroz pelea con el Señor Sith. Sin embargo, la ira es el lado oscuro de la fuerza. En este punto, Darth Maul lo empujó hacia abajo y tuvo que agarrarse a la protuberancia de la pared del pozo para salvar temporalmente su preciosa vida, y su sable de luz fue derribado de una patada. Al final, Obi-Wan se calmó y usó la Fuerza con calma para agarrar el sable de luz del maestro en el aire. Al mismo tiempo, saltó y cortó a Darth Maul en dos pedazos con una espada sorpresa.
Las últimas palabras de Qui-Gon pidieron a Obi-Wan que entrenara a Anakin, incluso si el Consejo se oponía. Sin embargo, el comité finalmente acordó que Obi-Wan debería aceptar a Anakin como su aprendiz, a pesar de las fuertes reservas del Maestro Jedi Yoda. El Consejo también concedió a Obi-Wan el título oficial de Caballero Jedi.