Hanyu empezó a patinar con su hermana cuando tenía 4 años. Al principio, estaba impaciente por el patinaje, pero se interesó más después de ver a su hermana trabajar duro en el patinaje artístico. A partir de entonces, se centró en su hermana menor, trabajó duro y consideró a Plushenko su ídolo.
La maravillosa actuación de la cabra patinadora Yuzuru Hanyu
En 2004, ganó la medalla de oro en el Grupo B del Campeonato Juvenil de Patinaje Artístico de Japón en la competencia nacional por primera vez. En 2006, ganó la medalla de bronce en el Grupo A del Campeonato Juvenil de Patinaje Artístico de Japón. Ese mismo año, terminó séptimo en el Campeonato Juvenil de Patinaje Artístico de Japón. En 2007, participó en el Campeonato de Japón de patinaje artístico juvenil y ganó el campeonato del Grupo A; ese mismo año, ganó la medalla de bronce en el Campeonato de Japón de patinaje artístico juvenil.
En 2008, hizo su debut en el Gran Premio Juvenil ISU, terminando sexto en el programa corto, cuarto en patinaje libre y quinto en la general. Ese mismo año, participó en el Campeonato Juvenil de Patinaje Artístico de Japón y ganó el campeonato con un programa corto de 57,52, un patinaje libre de 124,92 y una puntuación total de 182,17.
En 2009, ocupó el primer lugar en la Copa JGP Torun y en Croacia, ingresó con éxito a la final juvenil del Gran Premio de Patinaje Artístico ISU y finalmente ganó el campeonato. El 7 de marzo de 2010 participó en el Campeonato Mundial Juvenil de Patinaje Artístico, ocupando el tercer lugar en el programa corto, y logró un revés en el patinaje libre, convirtiéndose en el cuarto campeón del Campeonato Mundial Juvenil de Japón.