El árbol se puede girar 90 grados hacia la derecha y verse de arriba a abajo.
El árbol evolutivo está compuesto por nodos y ramas. Cada nodo representa una unidad taxonómica (género, población, individuo, etc.). Las ramas evolutivas definen la relación entre taxones (ancestros y descendientes), y una rama sólo puede conectar dos nodos adyacentes. La imagen de las ramas del árbol evolutivo se denomina topología evolutiva, en la que la longitud de la rama indica el grado de cambio durante la evolución de la rama. La rama evolutiva marcada con la longitud de la rama se denomina rama de escala.