En primer lugar, los genes tienen exones e intrones, y los exones se utilizan para codificar proteínas.
En segundo lugar, durante el proceso de transcripción del ADN en ARNm, el producto recién sintetizado ARNhn se corta para formar ARNm maduro. El ARNm maduro se traduce en proteína. A partir de esto, podemos saber que la secuencia de ADN y el ARNm maduro no se corresponden uno a uno. Por lo tanto, conocer la secuencia de ADN no significa conocer la secuencia de proteínas.
Finalmente, diferentes especies de organismos tienen preferencias de codones, y la traducción de codones no es necesariamente la misma. Por lo tanto, conocer la secuencia del ADN no significa conocer la secuencia de la proteína.