Los antiguos humanos del Japón fabricaban herramientas de producción sencillas y se dedicaban a la caza y la recolección.
En aquella época la gente vivía en cuevas. A finales del Mesolítico, la gente vivía en casas estilo cueva. Se excava una casa tipo pozo a unos 50 centímetros del suelo, con varios pilares de madera rodeándola para sostener el techo. La forma en planta de la casa es cuadrado redondeado, cuadrado, trapezoide, círculo, óvalo, etc. Después del primer período, había una estufa en el centro de la habitación. En Japón se han encontrado muchas casas tipo cueva y ruinas de pueblos compuestas de casas con agujeros verticales. Estos sitios reflejan la perspectiva social de las comunas de clanes en ese momento en diversos grados. La familia Hanawadai Kai en la prefectura de Ibaraki es un sitio que pertenece al período Jomon temprano. Aquí se encontraron ruinas de cinco casas de estilo de agujeros verticales y cerámica. Hay sitios de casas superpuestos y hay dos tipos de cerámica: con cordones y sin patrón. De esto se infiere que el sitio de Hualuntai fue una zona residencial que pasó por dos períodos. Hubo un tiempo en que sólo había dos o tres casas, con cuatro o cinco personas viviendo en cada casa. Los restos de dos hombres y mujeres adultos y un niño fueron encontrados en una casa estilo cueva en la casa de Laoshanbei en la ciudad de Ichikawa, prefectura de Ganye. Laoshan Kaijia es un sitio del período Jomon medio. A partir de este agujero vertical, podemos inferir el número de personas y las condiciones de vida que vivían en las primeras casas tipo agujero vertical. En una casa viven cuatro o cinco personas, mientras que en dos o tres casas sólo viven una docena de personas. La mayoría de las primeras aldeas Jomon estaban ubicadas en las cimas de colinas y mesetas o en laderas. Por lo general, eran de pequeña escala y de corta duración, esto se debía a que la gente en esa época se movía constantemente en busca de alimento. Este tipo de pequeña aldea es la zona de asentamiento del clan, y las casas estilo cueva son las residencias de los miembros de la comuna del clan.