La Universidad de Fuzhou comenzó a establecer una escuela de posgrado en 2005. La escuela tiene más de 8.400 estudiantes de posgrado. Es la única universidad piloto de reforma integral para la educación de posgrado de títulos profesionales en la provincia de Fujian y una universidad nacional innovadora para la educación de posgrado en ingeniería.
La Escuela de Graduados de la Universidad de Fuzhou se estableció oficialmente en diciembre de 2012, lo que construirá una plataforma más amplia para la construcción de la Facultad de Emprendimiento del Sureste de la Universidad de Fuzhou y promoverá la educación de grado y posgrado desde un punto de partida superior.
La escuela cuenta actualmente con casi 30.000 estudiantes de tiempo completo, incluidos casi 5.000 candidatos a doctorado y más de 2.000 posgraduados en diversas especialidades. Desde su creación, la escuela ha capacitado a más de 654,38 millones de graduados de maestría y pregrado a tiempo completo para el país.
Esta universidad está aprobada por el Ministerio de Educación de la República Popular China para reclutar estudiantes de pregrado y posgrado de Hong Kong, Macao y Taiwán. La escuela cuenta con dos bases de formación de talentos a nivel nacional, tres centros de demostración de enseñanza experimental a nivel nacional y más de 320 bases de enseñanza práctica fuera del campus dentro y fuera de la provincia.