La esencia es diferente y el método de formación es diferente.
1. Esencia: El agua destilada es agua pura obtenida por destilación, mientras que el agua ionizada es agua pura tras eliminar las impurezas en forma iónica.
2. Método de formación: el agua ionizada es agua casi pura que se obtiene eliminando las impurezas iónicas del agua a través de una resina de intercambio iónico. El agua destilada se elabora hirviendo el agua de origen y luego evaporándola y condensándola para recuperarla. Este proceso consume mucha energía térmica.