En 1808, Napoleón fundó la Universidad Imperial como la institución líder más alta para la administración de la educación nacional. El presidente de la Universidad Imperial (equivalente al Ministro de Educación) era nombrado directamente por Napoleón y estaba a cargo del establecimiento, eliminación, nombramiento y promoción del profesorado. El Imperial College también cuenta con un Senado y un Colegio de Gobernadores para ayudar al Director en la gestión de los asuntos educativos en todo el país. La Universidad Imperial tiene 29 distritos universitarios, que son paralelos a los distritos judiciales nacionales. Cada campus tiene un director designado por el director. También hay consejos de distrito escolar y superintendentes. Todas las universidades y escuelas secundarias de todo el país están bajo el liderazgo unificado del Salón de la Universidad Imperial. Las reglas y regulaciones, el plan de estudios y la organización de clases de las escuelas de todos los niveles y tipos son formulados y supervisados por el estado. El Director General, el Comandante en Jefe y los docentes son funcionarios del Estado y el Estado paga sus salarios. Este estricto sistema de administración educativa centralizada se ha convertido en la característica más importante del sistema educativo francés y ha seguido influyéndolo hasta el día de hoy.
Durante el Primer Imperio la escuela primaria no se tomaba en serio, pero la educación secundaria y superior se desarrolló mucho. Hay escuelas secundarias nacionales establecidas por el gobierno central y escuelas secundarias municipales establecidas por agencias de autogobierno local. Estos nombres todavía se utilizan hoy. Las escuelas secundarias nacionales forman principalmente a funcionarios administrativos y personal militar de alto rango. La gestión interna de la escuela es muy estricta. Los estudiantes visten ropa de uniforme. Según la organización del ejército, los tambores se utilizan para todos los movimientos en las escuelas. Se impondrán castigos severos a los estudiantes que violen las disciplinas. En comparación con las escuelas nacionales, las escuelas intermedias municipales tienen un estatus inferior, cursos más sencillos, una disciplina menos estricta y un mayor número de estudiantes que las escuelas intermedias nacionales.
Durante el Primer Imperio, la educación se desarrolló enormemente, transformando la caótica educación escolar original en un sistema educativo escolar relativamente sistemático y completo, y estableció el sistema educativo escolar francés moderno.