La Universidad Xi Jiaotong tiene un posicionamiento diferente. Evolucionó a partir de la Universidad Jiaotong. La escuela está posicionada como una escuela sólida en ciencias e ingeniería. A juzgar por los resultados actuales de la evaluación de materias, XJTU sigue siendo sólida en los campos de la ingeniería eléctrica, la ingeniería mecánica, la energía y la ingeniería energética. Aunque la fusión de la Universidad de Medicina de Xi'an ha compensado en gran medida las deficiencias de la Universidad Xi'an Jiaotong original, la posición dominante de la ingeniería no ha cambiado y los recursos asignados a varios departamentos no están lo suficientemente equilibrados.
La Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín siempre ha sido la mejor facultad de medicina del país y ha producido varios talentos médicos de primer nivel, como Zhong Nanshan y Tu Youyou. La carrera de medicina es una de las cartas de triunfo de la Universidad de Pekín y una de las razones por las que muchos candidatos se postulan para la Universidad de Pekín. En estas circunstancias, ya sea para mantener la posición dominante de la disciplina o para atraer estudiantes de alta calidad, el Departamento de Medicina ha recibido toda la atención de la Universidad de Pekín.
La Facultad de Medicina de la Universidad Xi'an Jiaotong tiene una fortaleza diferente. Anteriormente se conocía como Universidad Médica de Xi'an. La Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín, anteriormente conocida como Facultad de Medicina de Beijing; aunque, hasta cierto punto, la Facultad de Medicina de Beijing y la Universidad de Medicina de Xi tienen las mismas raíces, antes de la fusión y reorganización, la fuerza de las dos universidades era muy diferente. En ese momento, la Facultad de Medicina de Beijing estaba a la par, o incluso superada, las facultades de medicina de China Occidental, Xiangya y Tongji, y era el primer escalón de la educación superior médica en China.
Por otro lado, la Universidad Médica de Xi'an no tiene ventaja en términos de ubicación geográfica o recursos de desarrollo. Durante el proceso de desarrollo, perdió gradualmente su competitividad con la Universidad Médica de Beijing. En comparación con la Universidad de Pekín, la Universidad de Medicina Xi no es tan buena como la Universidad de Pekín en términos de calidad de profesores y estudiantes.
Sin embargo, el Departamento de Medicina de la Universidad Xi'an Jiaotong es relativamente débil en comparación con la Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín. En comparación con otras universidades, el Departamento Médico de XJTU todavía tiene una fuerte influencia. Ya sea el establecimiento de la sucursal de Xi'an de la Academia China de Ciencias Médicas o la selección de la alianza médica de primera clase, demuestra en gran medida que el reconocimiento de la Facultad de Medicina de la Universidad Xi'an Jiaotong aún es muy alto.