Alex Mercer estaba muerto cuando le dispararon en la comisaría y luego despertó en la morgue. Lo que todos manipulan en el juego no es humano en absoluto.
Es la herencia de la apariencia y personalidad de Alex después de que el virus de la botella rota estuviera en el cuerpo de Alex. El nombre del juego "Prototipo" también se refiere a él. En cierto nivel del juego, todavía puedes escuchar las palabras del general: "¡No! ¡Ya es imposible llamarlo! ¡Debería ser 'eso'!". Más tarde, al teléfono, también puedes ver a Alex y su " "colaborador". "diálogo: "Ah... ya no eres un ser humano, eres solo un virus del Black Watcher."