La institución colonial holandesa era la Compañía Holandesa de las Indias Orientales. Fundada en 1602, su secretario Weimarang llegó a Macao procedente de Batavia a través del estrecho de Malaca en 1603. La guerra con Portugal estaba perdida. 1604: Al llegar a Penghu el 7 de agosto, el ejército de Shen Yourong lo expulsó de la capital del Imperio Ming el 15 de febrero.
De 1601 a 1619, los Países Bajos y la Compañía Holandesa de las Indias Orientales libraron cinco guerras con Portugal para competir por Macao, todas las cuales terminaron en fracaso. Más tarde, el foco se centró en la provincia de Taiwán y Penghu fue capturado en 1622. En 1624, la guarnición de Penghu fue expulsada por el ejército Ming y se retiró a la provincia de Taiwán. En 1662, Zheng Chenggong lo expulsó de la provincia de Taiwán.